Mothra est un papillon géant. C’est aussi le Boss du Temple Les Bois du Crâne. Il ne possède qu’une seule attaque.
Pour le battre, vous pouvez utiliser le Bâton de Feu. Si vous n’avez plus de magie, vous pouvez le frapper avec votre épée. La difficulté réside dans le fait que le sol est amovible et que des pics viennent vous attaquer. A sa mort, vous recevrez un Conteneur de Cœur et le troisième cristal.