- Personnages cachés :

¤ Gargant : jouez en ayant sur votre Memory Card une sauvegarde d'Onimusha 3.

¤ Musaido : atteignez le niveau 2 d'expérience avec Trois-Yeux.

¤ Giramusaido : atteignez le niveau 3 d'expérience avec Musaido

¤ Gogandantess : finissez le mode Story avec les douze personnages de base, puis battez
Gogandantess en mode Versus.

¤ Jaido : atteignez le niveau 2 d'expérience avec Guerrier Zombi.

¤ Jujudormah Ran : finissez le mode Story deux fois avec Jujudormah puis battez Jujudormah Ran en mode Versus.

¤ Magoichi Saiga : faites 200 combats en mode Versus puis battez Magoichi Saiga en mode Versus.

¤ Marcellus P : atteignez le niveau 2 d'expérience avec Marcellus.

¤ Marcellus S : atteignez le niveau 3 d'expérience avec Marcellus.

¤ Megaman EXE 1 : finissez le mode Story avec Samanosuke Akechi puis battez Megaman EXE en mode Versus.

¤ Megaman EXE 2 : atteignez le niveau 2 d'expérience avec Megaman EXE.

¤ Megaman EXE 3 : atteignez le niveau 3 d'expérience avec Megaman EXE.

¤ Miyamoto Musashi : finissez le mode Story avec Grunt puis battez Miyamoto Musashi en mode Versus.

¤ Nobunaga Oda : finissez le mode Story avec les douze personnages puis battez Nobunaga Oda en mode Versus.

¤ Sasaki Kojiro : finissez le jeu avec Miyamoto Musashi puis battez Sasaki Kojiro en mode Versus.

¤ Zero 1 : récupérez les cristaux vert, bleu et violet avec Megaman EXE puis battez Zero en mode Versus. Finissez le Phantom Realm avec Megaman EXE pour avoir le cristal vert, le Phantom Realm 2 pour avoir le cristal bleu, et le mode Story pour avoir le cristal violet.

¤ Zero 2 : atteignez le niveau 2 d'expérience avec Zero.

¤ Zero 3 : atteignez le niveau 3 d'expérience avec Zero.