Tout simplement parce que la trame principale est décidée par l'auteur du manga alors que les films sont fais par des équipes d'animations à qui on confit le projet.
Souvent les auteurs essaient de s'impliquer plus ou moins dans l’élaboration des films en participant au scénario, en dessinant les personnages ou des petits trucs comme ça mais ça s’arrête là.

Le meilleure exemple de l'implication d'un auteur dans l’élaboration d'un film est celle d'Oda pour le film Strong World où il avait mentionné et inclut le personnage principale du film dans l'histoire et lui a donné un background important mais au final l'histoire du film restait quand même indépendante de la trame principale et n'avait aucune conséquence sur celle-ci.