Samus Aran, chasseuse de primes aguerrie et star de la galaxie, c'est sous cette apparence que notre héroïne remplit avec brio ses missions. Mais derrière ce personnage se cache une jeune femme au passé douloureux, et au destin hors du commun. Orpheline depuis sa plus tendre enfance, suite à l'attaque de sa colonie K2-L par les pirates de l'espace, Samus est recueillie par les Chozos, et élevée sur Zèbes. Là, elle passe une jeunesse heureuse, et s'enrichit spirituellement au contact des Chozos.

Elle se forge aussi une volonté de fer, et acquiert des qualités physiques qui lui seront très utiles pour l'avenir. Lorsque le moment est venu, elle doit néanmoins quitter son peuple d'adoption. Mais avant de se séparer, les Chozos lui offrent un sublime cadeau, une armure dans laquelle circule de leur propre sang, le Costume de Puissance[img] http://www.nintendo-difference.com/babynd/screens/news/gba/030513/metroid/samus.jpg[/img]Ainsi vétue, Samus entame sa carrière de chasseuse de primes, se jurant de venger la mort de sa famille. Et elle embarque dans son vaisseau spatial.
Sans se douter que sa première mission la ramènera en réalité ... sur Zèbes.

Raport n 1

La planète Zèbes... C'est ici que je vivais autrefois. Avant la guerre, bien avant que le mal ne hante les cavernes du dessous. C'est ici que j'ai livré ma première bataille, Ma Mission Zéro.
- Samus Aran -

Après sa victoire sur Kraid, Ridley et Mother Brain, et l'explosion de Tourian, Samus regagne son vaisseau ... et déséquipe son armure pour le voyage. Malheureusement, c'est à ce moment précis que Mécha-Ridley embarque toute la flotte des Pirates de l'espace, et attaque Samus ! Touché, le vaisseau va s'écraser sur Zèbes, à peine quelques secondes après son décollage.

Raport n 2

Après ma fuite, j'étais sans défense... privée de mon Costume de Puissance et avec pour seule protection, un pistolet de secours. Infiltrer le Vaisseau-Mère des pirates ainsi armée était de la folie, mais je n'avais pas vraiment le choix ....
Vivrai-je assez longtemps pour m'enfuir ?[img] http://psman59.free.fr/images/image_metroid-zero-mission16.gif[/img]

Ce faisant, Samus doit s'ex-filtrer du Vaisseau-Mère des pirates de l'espace, encore stationné sur Zèbes. Puis, elle réussit à rejoindre les vestiges Chozos, c'est à dire là où elle a en réalité grandie : Chozodia ! Sur place, elle active un ancien mécanisme Chozo, et récupère une nouvelle Power Suit ! Ainsi parée, elle peut désormais retourner sans crainte au Vaisseau-Mère des pirates de l'espace, et s'échapper de Zèbes à bord de l'un de leurs propres vaisseaux. Mais Mécha-Ridley lui barre la route, et lorsqu'elle décole, la Vaisseau-Mère explose à son tour, laissant la planète Zebès en ruines.