L'histoire du jeu se déroule sur l'île d'Illusia qui fût sauvée autrefois par un garçon, une fille, une épée magique (l'Épée Mana) et un arbre sacré (l'Arbre Mana). Sous cet arbre s'est installé un petit village qui compte trois enfants Frick, Tumble et Pop, les trois personnages principaux du jeu. Le système de combat permettra d'associer différentes armes longue et courte portée (épée, arc, fouet, etc.) aux deux boutons A et X de la console portable. Chaque arme devrait disposer d'un attaque normale, d'une attaque spéciale, et d'une furie (pluie de flèches, coup à 360°, vague de coups d'épée) qui pourra être déclenchée lorsque la jauge de puissance 'Fever Gauge' est au maximum, il faudra lancer des attaques standards sur les ennemis pour remplir cette jauge. L'écran tactile permettra principalement de naviguer dans l'interface pour afficher la carte, changer d'armes, et équiper son personnage avec de nouveaux objets. L'équipe de développement annonce 25 à 30 heures de jeu pour la quête principale, d'autres quêtes secondaires seront également disponibles. Par ailleurs, Square Enix n'a pas encore confirmé la présence d'un mode multijoueur pour le moment. La sortie de Seiken Densetsu DS : Children of Mana est prévue pour début 2006 au Japon.
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