La république d'Extrême Orient, une nation totalitaire située en Asie, expérimente un jeu de massacre appelé le programme. Des classes de 3ème du pays sont choisies arbitrairement pour y participer. Les élèves d'une même classe doivent s'entretuer jusqu'à ce qu'il ne reste plus qu'un seul survivant. Telle en est la cruelle règle. Les 42 élèves de la classes de 3ème du collège de Shiroiwa se retrouvent engagés dans ce véritable jeu de la mort sans même savoir pourquoi.