Metal Gear Solid 3 Subsistence embarquera des nouveaux modes de jeux par rapport à Snake Eater. Point d'orgue, le multijoueur en ligne jouable jusqu'à huit simultanément avec au menu des missions d'infiltrations, de sauvetages, de capture, et même les deathmatchs. Les cartes proposées reprendront les scènes les plus intéressantes de MGS 3 plus quelques nouvelles créées pour l'occasion (Small Forest, Kill House, Abolition Factory)

A l'instar de MGS 3, nous pourrons choisir notre difficulté de jeu, et son personnage parmis les troupes d'Ocelot, le GRU ou encore le KGB. Si vous jouez bien il sera possible de débloquer les personnages principaux dont Ocelot justement.