- Ecran titre :
Pour que votre écran titre soit bleu, il faut que vous ayez finit le jeu en une fois.

- Mode de jeu plus difficile :
Pour avoir un mode de difficulté en plus, finissez le jeu.

- Votre nom sur le générique de fin :
Lorsque vous êtes dans l'usine, dès que vous aurez trouvé l'ordinateur du radar, Raiden devra y inscrire des informations personnelles. Insrcivez votre nom, votre sexe, votre date de naissance, votre groupe sanguin et votre nationalité. Après le générique de fin, toutes ces informations seront inscrites sur la médaille que porte Raiden.

- Profil de Hideo Kojima :
Lorsque vous êtes devant l'ordinateur, dans l'usine, entrez le nom de Hideo Kojima pour avoir des informations le concernant.

- Soldat malade :
Lorsque vous êtes dans la pièce avec les otages et que vous devez écouter la conversation entre Solidus et Ocelot, déplacez le micro sur la gauche en direction des toilettes, vous entendrez à ce moment là un soldat malade.

- Améliorer la jauge de grip :
Deux façons sont connues pour améliorer votre jauge de grip. Soit vous faites une centaine de tractions pour augmenter d'un niveau (maximum niveau 3) soit vous vous lâchez et vous rattrapez à une barrière plus bas une dizaine de fois.

- Soladts à la mer :
Au début du jeu, assommez les gardes et transportez-les sur un des côtés du bateau. Snake se chargera de les jeter à l'eau.

- Réveiller les soldats :
Pour réveiller les soldats, utilisez le spray réfigérant en visant leurs visages.

- Mode Casting Theater :
Dès que vous aurez terminé le jeu, entrez dans le menu special et choisissez l'option Casting Theater. Vous pourrez alors revoir toutes les cinématiques du jeu en modifiant les personnages à l'écran.