Contrairement à l'année dernière, et sauf annonce de dernière minute, Square Enix n'organisera pas de conférences à l'E3 2016 mais sera néanmoins présent pour présenter via Twitch ses derniers produits, avec une première vague décrite ci-dessous :

- Deus Ex : Mankind Divided
- Just Cause 3 : Extension Land Mech Assault
- Star Ocean : Integrity and Faithlessness
- I am Setsuna
- Hitman : troisième zone

La seconde partie du programme sera prochainement dévoilée, avec la certitude de voir du Lara Croft probablement en rapport avec le futur lancement PS4 de Rise of the Tomb Raider, et on peut également mettre une petite pièce sur du NieR Automata et Final Fantasy XV.