A l'aube du XXe siècle, une organisation secrète du nom Les Philosophes vit le jour, dans l'ombre des gouvernements des 3 puissances de l'époque: Les USA, l'URSS et la Chine.
Chargée de réguler l'ordre internationale, cette organisation exerçait jusqu'en 1930 (date de mort du dernier des membres originaux), une très forte influence au sein de ces trois nations.

Durant l'entre-deux-guerre, les 3 branches collectèrent une somme faramineuse afin de garantir l'équilibre du monde en entretenant les armements notamment.
L'Héritage des Philosophes permit ainsi à ces trois nations de mettre fin à l'hégémonie nazie en Europe lors de la Seconde Guerre mondiale en abattant les puissances de l'Axe.
Toutefois, l'union soviétique parvint à mettre la main sur l'Héritage, bénéficiant du chaos général suite à ce nouveau conflit. Ainsi, l'un de ses agents, Boris Volgin (père de Yevgeny Volgin), établit diverses stratégies afin d'assurer à sa patrie le contrôle de l'Héritage. L'argent fut ainsi détourné vers une multitude de banques à travers le monde.
Le détail des transactions, quant à lui, fut inscrit sur un microfilm.



Au terme de cette opération, les 3 branches s'entre-déchirèrent afin de récupérer l'Héritage, chacune espérant s'accaparer la totalité de la somme
La Guerre froide éclata ainsi dans une atmosphère délétère entre les 3 puissances, en plein cœur des années 1960.

Metal Gear Solid 3: Snake Eater relate les évènements survenus suite à la bipolarisation de l'espace mondial, lorsque chacune des 3 puissances s'efforcèrent de récupérer l'Héritage des Philosophes.

Colonel du GRU et fils de Boris Volgin, Yevgeny Volgin était, à l'époque, membre d'une faction extrémiste aspirant à endosser le rôle de chef au sein de l'union soviétique. Il briguait ainsi la tête du P.C., avide d'y renverser Khrouchtechev -déchu depuis la Crise de Cuba en 1962- afin d'y installer Brejnev et Kossyguine.
Ayant reçu l'Héritage des Philosophes de son père, Volgin souhaitait employer ces fonds afin de dominer l'ordre international à la tête d'une union soviétique inébranlable.
Pour ce faire, il devait à tout prix détenir l'Arme du XXIe siècle, une arme de dissuasion majeure, machine nucléaire et meurtrière, afin qu'aucune nation ne puisse contester l'hégémonie soviétique...



Nous sommes le 24 août 1968, un MC-130 Combat Talon survole Tselinoyark, en Russie. A son bord, le Major Zero est accompagné d'un agent issu de la toute nouvelle unité américaine FOX (Force Operation X).
Ce dernier a pour mission d'infiltrer le complexe de recherches soviétiques afin d'arracher Nikolai Stephanovich Sokolov des mains du KGB. Snake est informé par le Major Zero -nommé Major Tom à l'occasion- que ce scientifique est l'auteur d'un tank bipède (Shagohod), projet intéressant vivement l'union soviétique (vous concevrez sans trop de mal l'importance d'une arme de dissuasion nucléaire dans un conflit tel que celui-ci).
L'agent, baptisé Naked Snake, exécuta le premier saut HALO au monde afin d'atteindre le territoire ennemi.

Bien que Snake parvint aisément à regagner l'endroit où était détenu le scientifique, la Virtuous Mission (ouai en anglais ça fait mieux) fut un échec cuisant pour l'unité FOX.
Notre agent adepte de l'infiltration, eut en effet la mauvaise surprise de tomber nez à nez avec son ancien mentor, The Boss, supposée se trouver en Antarctique pour le compte d'un mission secrète. Cette dernière lui révéla qu'elle avait décidé de rejoindre le camps soviétique, au service de la "Mère Russie".
Laissé pour mort dans le fleuve en contrebas, Snake aperçut l'unité Cobra quitter les lieux à bord de Hind-A, accompagné de Sokolov.
Volgin avait ainsi toutes les cartes en main afin de renverser Khrouchtchev; il possédait dès maintenant le Shagohod et parvint à convaincre The Boss de rallier sa cause grâce au réseau d'espions des Philosophes.
Ce dernier, visiblement satisfait de la tournure des événements, provoqua une explosion nucléaire, annihilant totalement le complexe scientifique OKB-754, à l'aide d'un des deux Davy Crockett offert par The Boss.









Cette explosion, loin d'être anodine, réveilla les vieux démons de la Guerre Froide en opposant, une fois de plus l'union soviétique aux Etats Unis.
Khrouchtchev suspecte en effet son alter-ego américain, le président Jonhson d'être le responsable de la frappe nucléaire -l'avion de l'unité FOX fut effectivement détecté par les radars soviétiques-.
John McCone, alors à la tête de la CIA, décida de sacrifier The Boss afin d'attester l'innocence des USA dans cette attaque nucléaire; il confia la mission à son meilleur disciple: Jack alias Naked Snake.



Snake est ainsi renvoyé à Tselinoyark le 30 août à bord d'un drone D-21 afin de satisfaire les exigences de son président et accessoirement éviter un drame nucléaire.
Sur les lieux, Snake est supposé retrouver ADAM -unes des taupes américaines infiltrées en territoire ennemie- chargé de l'aider à accomplir sa mission. Cependant, il ne rencontra qu'une espionne dénommée EVA qui prétend être une ancienne décodeuse de la NSA; incapable de répondre "La-li-lu-le-lo" (voir rubrique "Le point sur les Patriotes") à la question "Who are the patriots", celle-ci lui assura que son acolyte ne pouvait se rendre au lieu du Rendez-vous et lui offrit son aide afin de retrouver Sokolov en gage de bonne confiance.

A l'insu de Snake, cette dernière se faisait également passer pour Tatyana, la maîtresse de Sokolov afin d'être au plus près de l'entourage de Volgin ... et de son Héritage.

Naked Snake, avec l'aide de Aleksandr Leonovitch Granin, parviendra à pénétrer au sein de la forteresse de Volgin: Groznij Grad.
Designer originel du projet Metal Gear, Granin fut affecté par la décision du colonel du GRU qui lui préféra le Shagohod conçu par Sokolov. Noyant son chagrin dans l'alcool, le scientifique révéla à Snake où était détenu son homologue.
Snake parvint donc à retrouver Sokolov affublé de l'uniforme de Raikov -amant de Volgin- à la grande surprise de celui-ci. Torturés, le scientifique y perdra la vie, Snake son œil droit.
Après s'être échappé de la forteresse, Snake retrouva EVA avec laquelle il se débarrassa du Shagohod et de Thunderbolt (alias Volgin) mortellement frappé par la foudre.



Une ultime mission attendait cependant Snake: dominer son mentor, éliminer The Boss.



Défait par son ancien apprenti, celle-ci lui remit le microfilm sur lequel était inscrit les codes d'accès à l'Héritage des Philosophes avant de s'éteindre à jamais ...

De retour sur le sol américain, EVA, femme fatale mais emplit de mystère, quitta Jack à l'aube, lui laissant simplement une bande magnétique sur laquelle était décrite sa véritable identité ainsi que le réel sacrifice de The Boss.



Snake -et nous, joueurs- apprenons ainsi qu'EVA est une agent de la branche chinoise des Philosophes.
Celle-ci soutient la cause de Snake afin de faire progresser la sienne: mettre la main sur l'Héritage des Philosophes et en faire bénéficier la Chine, nation en retrait durant ce conflit glacial.
Sa double personnalité -rappelons qu'elle joue également le rôle de Tatyana-, lui permettra de dégoter cette fameuse somme. Malheureusement, le Colonel Volgin la devancera et s'apercevra de sa fourberie.
The Boss, ayant découvert sa véritable identité, lui évitera une fin... électrique mais l'adjura d'épargner Snake en échange de l'Héritage des Philosophes -celui-ci n'étant qu'une simple copie-.
Obéissant conformément aux vœux de The Boss, EVA épargnera finalement Snake avant de repartir pour la Chine avec ce qu'elle croit être l'Héritage des Philosophes.



L'opération Snake Eater est donc un coup de maître monté par les États Unis afin de récupérer l'Héritage des Philosophes.
La mission de The Boss consistait en effet à intégrer les rangs du Colonel Volgin afin de lui subtiliser l'Héritage.
Toutefois, suite à la frappe nucléaire provoquée par le colonel du GRU, The Boss réalisa qu'il fallait y laissait sa vie afin de duper l'union soviétique.
En plus de EVA et The Boss, Ocelot (fils de The Boss et The Sorrow), portait également une double casquette auprès de ses pairs soviétiques. Chargé par le directeur de la CIA, McCone, du bon déroulement de l'opération Snake Eater, c'était lui (Adamska), l'ancien décodeur de la NSA, que devait retrouver Snake.
Constatant qu'EVA remplissait son rôle, il ne dévoila jamais sa véritable identité (ADAM), agissant dans l'ombre pour le compte de l'union soviétique et des États Unis à la fois.

Malgré son nouveau titre de Big Boss, Snake n'oubliera jamais le véritable maître, The Boss qui sacrifia sa vie et son titre en l'honneur de sa patrie; une véritable Patriote qui sera à jamais honnie par le pays pour lequel elle a donné sa vie.
Avant de mourir, celle ci témoigna son désir d'assister à l'unification des peuples, un projet idyllique seulement réalisable avec l'Héritage des Philosophes selon elle.




Suite à cette opération, la branche américaine des Philosophes parvint donc à récupérer la moitié de l'Héritage des Philosophes avant d'en détenir la totalité en 1970.
A cette date, elle se sépara du groupe originel afin de former les Patriotes, exerçant ainsi une domination inébranlable et supplantant peu à peu les 2 autres puissances.